More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5454 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  96.9 
 
 
258 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  95.74 
 
 
258 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  95.74 
 
 
258 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  91.05 
 
 
271 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  91.09 
 
 
272 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  90.66 
 
 
271 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
322 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  88.76 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  87.98 
 
 
258 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  78.29 
 
 
258 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  75.97 
 
 
258 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  76.26 
 
 
258 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  73.28 
 
 
275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  70.23 
 
 
265 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  68.42 
 
 
269 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  68.05 
 
 
269 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  68.05 
 
 
269 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  62.79 
 
 
255 aa  344  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  62.02 
 
 
254 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  62.2 
 
 
256 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  59.06 
 
 
282 aa  332  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  64.17 
 
 
254 aa  332  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  61.09 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  59.34 
 
 
288 aa  321  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 
277 aa  316  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  60.63 
 
 
255 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  58.91 
 
 
260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  58.14 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  55.73 
 
 
258 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  54.96 
 
 
258 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  56.47 
 
 
255 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 
258 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 
258 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  53.73 
 
 
257 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.75 
 
 
254 aa  295  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  57.14 
 
 
267 aa  291  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  54.55 
 
 
255 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  53.36 
 
 
256 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  54.12 
 
 
267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  53.36 
 
 
256 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  56.49 
 
 
258 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  54.65 
 
 
274 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  52.76 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  54.69 
 
 
258 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  52.16 
 
 
256 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  54.55 
 
 
264 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  55.34 
 
 
259 aa  275  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  54.15 
 
 
264 aa  274  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  47.69 
 
 
260 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  46.51 
 
 
260 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  46.77 
 
 
265 aa  240  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  47.06 
 
 
237 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  51.18 
 
 
257 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  51.18 
 
 
257 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 
261 aa  238  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 
262 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 
262 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  44.87 
 
 
268 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 
281 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  40.68 
 
 
275 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  44.96 
 
 
261 aa  224  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  40.68 
 
 
275 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  39.16 
 
 
281 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  43.24 
 
 
262 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 
281 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 
281 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  42.75 
 
 
260 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  41.83 
 
 
279 aa  215  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  44.23 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  44.09 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  42.02 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 
258 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 
260 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  44.27 
 
 
257 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.15 
 
 
266 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  44.49 
 
 
255 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 
263 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 
303 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  43.08 
 
 
264 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 
265 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 
270 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  44.57 
 
 
262 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  40.61 
 
 
263 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  43.89 
 
 
266 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  44.96 
 
 
258 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 
263 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  44.31 
 
 
269 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 
264 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  40.31 
 
 
262 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 
277 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>