More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1079 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  63.4 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  65.28 
 
 		 264 aa  341  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  63.2 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  61.13 
 
 		 291 aa  329  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  61.57 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  59.77 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  62.64 
 
 		 275 aa  321  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  60.75 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  61.51 
 
 		 267 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  59.4 
 
 		 264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  61.03 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  61.51 
 
 		 267 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  61.51 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  62.41 
 
 		 266 aa  319  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  59.02 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  60.15 
 
 		 272 aa  317  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  60.07 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  59.64 
 
 		 281 aa  313  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  60 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  58.65 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  50.79 
 
 		 316 aa  294  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  52.63 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  50.76 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  52.65 
 
 		 259 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  52.45 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  52.83 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  50.18 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  51.32 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  47.53 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  42.05 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.06 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  42.75 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.7 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.07 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.07 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  39.92 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  41.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  40.67 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  41.79 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  44.32 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  35.98 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  40.82 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  35.61 
 
 		 275 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  39.7 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  41.04 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.42 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  37.73 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.83 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  41.04 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.42 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.67 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.42 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  39.54 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.25 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  39.25 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  41.13 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.11 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  40.82 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  38.64 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  36.98 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  39.54 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.78 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.6 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  36.56 
 
 		 282 aa  175  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.33 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  39.77 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  36.98 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  37.64 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  38.81 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  39.77 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.83 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>