More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25800 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  68.3 
 
 		 266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  64.53 
 
 		 275 aa  348  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  62.41 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  64.77 
 
 		 264 aa  341  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  63.5 
 
 		 281 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  60.61 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  62.88 
 
 		 263 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  59.18 
 
 		 294 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  62.41 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  61.05 
 
 		 291 aa  318  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  60.67 
 
 		 268 aa  315  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  59.47 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  57.58 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  56.83 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  55.93 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  55.81 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  55.81 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  55.81 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  50.79 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  52.96 
 
 		 259 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  52.27 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  49.25 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  48.15 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  51.49 
 
 		 304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  52.24 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  48.13 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  45.99 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  47.01 
 
 		 289 aa  224  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  43.98 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  46.24 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  41.67 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  43.82 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  40.23 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  40.75 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  39.47 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.42 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.29 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  39.93 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 322 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  41.89 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  41.89 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  41.26 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  40.98 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  40.6 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  38.81 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  41.11 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  39.56 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  38.52 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.64 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  36.6 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  38.52 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  36.8 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  36.1 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  37.08 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  42.26 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  38.43 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  40.91 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  40.91 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  38.49 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  37.09 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  38.11 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  37.92 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  37.97 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  36.74 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  38.72 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  37.08 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  36.8 
 
 		 260 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  38.11 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  32.08 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  34.59 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  32.08 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>