More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0357 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  59.44 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  54.33 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  53.94 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  55.34 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  57.6 
 
 		 255 aa  281  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  55.91 
 
 		 256 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  56.3 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  54.62 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  54.94 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  54.33 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  54.2 
 
 		 275 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  55.91 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  55.51 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  54.09 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  55.16 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  54.22 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  55.86 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  50.76 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  52.71 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  50.39 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  51.16 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  51.57 
 
 		 258 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  51.18 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  50.58 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.18 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  51.18 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  49.44 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  48.83 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  50.56 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  51.17 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  48.43 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  50 
 
 		 237 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  48.82 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  48.43 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  48.29 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  48.65 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  49.22 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  49.03 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  49.42 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  49.42 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  47.71 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  47.86 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  51.36 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  41.29 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.84 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  44.83 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  46.01 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  46.69 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  45.11 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  45.96 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  41.98 
 
 		 281 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  46.46 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  46.06 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  46.04 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  40.46 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  43.46 
 
 		 260 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  40.46 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  40.46 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  46.01 
 
 		 289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  42.21 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  47.67 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  43.89 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  45.6 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  43.98 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  42.35 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  43.14 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  40.31 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  44.53 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  45.02 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  42.19 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  44.32 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  43.63 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.08 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  42.05 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  46.42 
 
 		 297 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  40.84 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>