More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0685 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  97.27 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  63.64 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  61.42 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  62.06 
 
 		 255 aa  323  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  57.31 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  57.71 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  56.52 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  54.94 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  55.34 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  55.68 
 
 		 265 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  54.86 
 
 		 258 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  54.86 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  57.59 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  54.65 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  54.72 
 
 		 267 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  55.47 
 
 		 264 aa  293  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  56.13 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  55.08 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  54.9 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  53.75 
 
 		 258 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.75 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  53.75 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  53.36 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  51.79 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  58.62 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  52.76 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  54.33 
 
 		 259 aa  284  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  52.76 
 
 		 271 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  52.76 
 
 		 271 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.75 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  53.54 
 
 		 258 aa  279  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  52.57 
 
 		 256 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  54.33 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  54.33 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  50.55 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  51.53 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  51.53 
 
 		 269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  51.15 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  51.38 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  48.08 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  49.82 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  47.89 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  48.85 
 
 		 260 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  49.05 
 
 		 282 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  48.83 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  48.64 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  48.64 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  48.65 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  48.45 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  46.9 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  44.11 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  45.8 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  46.24 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  43.89 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  43.89 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  45.21 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 		 275 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  43.46 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  45.8 
 
 		 288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  46.25 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  40.46 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  41.9 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  41.47 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  42.02 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  42.02 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  43.51 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  42.02 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  41.06 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  38.46 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  40.84 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  39.77 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  43.18 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.5 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  40.68 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  38.08 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 		 262 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.69 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  39.18 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  40.61 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>