More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 281 aa  567  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  60.36 
 
 		 264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  63.37 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  62.77 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  63.5 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  59.64 
 
 		 264 aa  331  8e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  61.76 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  60.43 
 
 		 268 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  60.07 
 
 		 263 aa  327  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  60.43 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  59.41 
 
 		 263 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  57.72 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  59.64 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  61.01 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  58.82 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  58.82 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  58.61 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  58.46 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  59.57 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  58.33 
 
 		 291 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  58.36 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  56.25 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  49.54 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  53.16 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  51.09 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  50.74 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  52.42 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  50.17 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  51.46 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  51.82 
 
 		 297 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  49.27 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  48.72 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  45.96 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.45 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.22 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  40.07 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  38.52 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.11 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  38.89 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  39.78 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  39.71 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  45.39 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  38.97 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  40.28 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.43 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  41.48 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  38.89 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  39.18 
 
 		 257 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  40.59 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  41.85 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  40.67 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  35.06 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  38.97 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  38.97 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  39.48 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  34.66 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  35.42 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  41.48 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  41.48 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  39.1 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  37.27 
 
 		 262 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  37.27 
 
 		 262 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  37.41 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  38.6 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  38.3 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  39.27 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.11 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  38.3 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  39.11 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  33.94 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  36.4 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  40.3 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  37.41 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  38.15 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  37.86 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  40.58 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  35.64 
 
 		 260 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  38.15 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  36.63 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  40.22 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.4 
 
 		 262 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.9 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.55 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>