More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0419 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  86.57 
 
 		 268 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  71.27 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  71.27 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  67.04 
 
 		 266 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  64.93 
 
 		 263 aa  361  9e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  65.79 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  65 
 
 		 291 aa  358  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  65.3 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  63.06 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  66.17 
 
 		 275 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  64.42 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  62.41 
 
 		 264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  64.6 
 
 		 272 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  62.87 
 
 		 272 aa  331  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  63.2 
 
 		 267 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  63.2 
 
 		 267 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  62.83 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  60.43 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  61.57 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  59.18 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  54.4 
 
 		 316 aa  319  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  58.21 
 
 		 262 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  55.97 
 
 		 259 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  51.85 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  49.06 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  50.74 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  47.55 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  48.33 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  48.15 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  48.15 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  45.66 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 257 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  39.63 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  42.96 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.28 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  39.33 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  39.33 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  41.73 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  41.42 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41.64 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.6 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  40.38 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  40.37 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.85 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.85 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  35.98 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  39.71 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  39.47 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  42.16 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.71 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  38.06 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  39.25 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  38.1 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  39.03 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  39.34 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.57 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  38.35 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.76 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  39.41 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.96 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  38.66 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  36.76 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.09 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  36.5 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  39.33 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  38.89 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.1 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  36.16 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  39.11 
 
 		 258 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  39.11 
 
 		 258 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  40.81 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  40.81 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  40.81 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  36.5 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  39.26 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  40.67 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  38.89 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>