More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0661 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 288 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  79.34 
 
 		 282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  73.65 
 
 		 279 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  63.27 
 
 		 277 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  52.73 
 
 		 275 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  50.9 
 
 		 281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  53.26 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  51.26 
 
 		 281 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  50.19 
 
 		 281 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  53.05 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  52.29 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  52.26 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  50.76 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  46.95 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  45.8 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  45.25 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  46.01 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  46.01 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  44.27 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  46.01 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  45.38 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  44.27 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  45.04 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  43.61 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  44.87 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  43.07 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  44.07 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 		 254 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  43.51 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  44.27 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  44.11 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  40.81 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  42.11 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.37 
 
 		 254 aa  205  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  43.73 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  41.89 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  43.23 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  43.02 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  43.23 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  43.98 
 
 		 237 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 265 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 258 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 264 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  42.26 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  40.82 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  38.35 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  38.35 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.95 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  39.78 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  41.33 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  37.97 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  39.48 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  41.35 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  38.87 
 
 		 262 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  40.98 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  38.87 
 
 		 259 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  38.87 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  41.13 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  41.33 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  39.34 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  41.7 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 		 262 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  39.25 
 
 		 259 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.7 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  40.7 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  37.82 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  36.64 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  38.2 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  39.18 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  37.02 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  41.06 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>