More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01950 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
275 aa  564  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  70.91 
 
 
268 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  71.27 
 
 
294 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  64 
 
 
264 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  62.77 
 
 
264 aa  340  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  62.77 
 
 
264 aa  332  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  62.18 
 
 
275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  61.96 
 
 
266 aa  322  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  62.18 
 
 
263 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  58.55 
 
 
264 aa  315  7e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  57.82 
 
 
263 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  61.01 
 
 
281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  60 
 
 
291 aa  309  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 
266 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  60.58 
 
 
267 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  60.58 
 
 
267 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  59.64 
 
 
272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  60.22 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  60 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  58.18 
 
 
264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  59.29 
 
 
272 aa  295  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  52.53 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  54.51 
 
 
262 aa  278  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  50.72 
 
 
304 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  51.08 
 
 
297 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  50.91 
 
 
259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  48.35 
 
 
265 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  47.99 
 
 
265 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  47.59 
 
 
282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  47.83 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  46.04 
 
 
289 aa  208  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  45.16 
 
 
293 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  43.53 
 
 
254 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  42.39 
 
 
262 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  43.68 
 
 
262 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  43.37 
 
 
258 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
322 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.94 
 
 
254 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  40.51 
 
 
256 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  40.22 
 
 
258 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  41.45 
 
 
258 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  41.45 
 
 
258 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  40.29 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  42.65 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  43.64 
 
 
258 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.73 
 
 
255 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  43.01 
 
 
258 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  43.01 
 
 
258 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.82 
 
 
261 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 
262 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 
277 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 
262 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  41.34 
 
 
269 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  41.45 
 
 
256 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  39.27 
 
 
255 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  39.22 
 
 
269 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  39.93 
 
 
257 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  41.3 
 
 
259 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  41.3 
 
 
259 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  38.63 
 
 
264 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.65 
 
 
258 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  42.65 
 
 
258 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  41.22 
 
 
258 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  42.18 
 
 
258 aa  175  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  38.63 
 
 
264 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  38.16 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  38.63 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  37.82 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.82 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  37.91 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  39.27 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 
263 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 
258 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  38.77 
 
 
270 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 
269 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
275 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  38.55 
 
 
261 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 
263 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 
272 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  39.64 
 
 
254 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.73 
 
 
271 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  37.96 
 
 
256 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  38.52 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  40.36 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  37.19 
 
 
282 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  40.36 
 
 
258 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  39.27 
 
 
254 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  39.64 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>