More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0656 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  59.47 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  59.62 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  58.21 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  59.54 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  58.17 
 
 		 264 aa  305  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  56.67 
 
 		 266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  58.8 
 
 		 291 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  56.77 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  56.34 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  56.23 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  56.62 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  57.04 
 
 		 272 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  56.65 
 
 		 275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  54.72 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  50.63 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  54.51 
 
 		 275 aa  278  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  52.63 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  52.27 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  51.09 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  49.11 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  48.87 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  45.86 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  45.11 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  47.55 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  39.62 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  40.89 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 260 aa  185  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.98 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  39.92 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.64 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  39.02 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  37.97 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  37.88 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  39.77 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  39.1 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.75 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  40.77 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  36.98 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  41.54 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  42.42 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  38.78 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.64 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  39.31 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  39.02 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  39.48 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  38.66 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.55 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  38.55 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  39.02 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  39.11 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  38.55 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  37.88 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.09 
 
 		 281 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  39.23 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  39.63 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  39.63 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  37.4 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  36.15 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  36.88 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  37.08 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  37.83 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  37.83 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>