More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0703 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  531  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  97.27 
 
 
256 aa  521  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  62.45 
 
 
255 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  60.24 
 
 
256 aa  321  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  60.87 
 
 
255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  57.71 
 
 
277 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  56.52 
 
 
255 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  54.94 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  55.73 
 
 
255 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  54.94 
 
 
254 aa  299  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  54.47 
 
 
258 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  55.68 
 
 
265 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  54.47 
 
 
258 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  56.13 
 
 
258 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  55.04 
 
 
275 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  54.33 
 
 
267 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  55.47 
 
 
264 aa  294  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  57.2 
 
 
258 aa  293  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  55.08 
 
 
264 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  53.75 
 
 
258 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.75 
 
 
258 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  53.75 
 
 
258 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  54.9 
 
 
254 aa  288  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  53.36 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  52.19 
 
 
257 aa  287  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
322 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 
272 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  54.33 
 
 
259 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 
271 aa  284  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 
271 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  57.76 
 
 
237 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  53.94 
 
 
258 aa  281  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  52.96 
 
 
256 aa  280  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.96 
 
 
254 aa  280  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  52.29 
 
 
269 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  53.94 
 
 
257 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  51.91 
 
 
269 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  53.94 
 
 
257 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  48.46 
 
 
260 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  51.15 
 
 
269 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  50.99 
 
 
274 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  48.25 
 
 
258 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  48.28 
 
 
261 aa  265  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  49.45 
 
 
282 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  49.81 
 
 
282 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  48.46 
 
 
260 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 
258 aa  258  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  48.64 
 
 
258 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  48.64 
 
 
258 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  48.26 
 
 
260 aa  254  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  47.66 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  44.49 
 
 
281 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  46.12 
 
 
261 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  46.24 
 
 
268 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  45.8 
 
 
265 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  46.95 
 
 
288 aa  241  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 
279 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  43.89 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  45.59 
 
 
277 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  43.89 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  43.13 
 
 
281 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  43.46 
 
 
275 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 
281 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  47.04 
 
 
258 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 
281 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 
254 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  42.25 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
259 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  42.41 
 
 
259 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  41.86 
 
 
265 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  41.63 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  43.13 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 
264 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 
259 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  38.08 
 
 
263 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  38.46 
 
 
262 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  39.38 
 
 
261 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 
264 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  38.08 
 
 
276 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  40.46 
 
 
275 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 
267 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  43.18 
 
 
263 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.94 
 
 
260 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.69 
 
 
266 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  37.79 
 
 
262 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  41.7 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 
259 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  38.81 
 
 
268 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>