More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2484 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  60.63 
 
 		 255 aa  320  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  58.04 
 
 		 255 aa  318  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  59.77 
 
 		 254 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  60.08 
 
 		 267 aa  301  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  59.22 
 
 		 256 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  57.65 
 
 		 255 aa  298  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  57.75 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  55.68 
 
 		 275 aa  294  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  55.73 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  57.48 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  55.51 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  55.81 
 
 		 258 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  56.59 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  56.59 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  56.59 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  56.59 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  55.81 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  59.14 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  56.47 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  56.47 
 
 		 271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  56.08 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  55.51 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  53.75 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  52.96 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  53.03 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  51.87 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  53.33 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  51.71 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  53.79 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  55.29 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  53.88 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  54.9 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  53.88 
 
 		 258 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  51.55 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  51.36 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  47.1 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  50.39 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  52.9 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  52.79 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  50.2 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  48.63 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  50.99 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  48.85 
 
 		 260 aa  242  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  45.8 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  45.8 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  51.16 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  48.09 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  39.54 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  46.95 
 
 		 282 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 		 277 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  44.94 
 
 		 268 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  39.16 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  45.98 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  38.22 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  44.49 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  45.74 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  47.64 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  47.84 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  47.84 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  43.8 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  45.98 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  43.8 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  44.57 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  43.7 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.92 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  43.14 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  43.63 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.8 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  47.08 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  42.47 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 264 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 264 aa  197  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  42.52 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  43.68 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>