More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3155 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 316 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  59.49 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  60.13 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  59.18 
 
 		 263 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  57.28 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  58.6 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  54.4 
 
 		 294 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  55.24 
 
 		 266 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  54.78 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  55.73 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  52.52 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  55.66 
 
 		 267 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  55.66 
 
 		 267 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  53.18 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  50.79 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  52.53 
 
 		 275 aa  301  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  50.63 
 
 		 262 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  51.88 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  50.32 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  49.54 
 
 		 281 aa  287  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  50.79 
 
 		 266 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  46.35 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  42.9 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  39.81 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  42.63 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  63.41 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  59.76 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  57.22 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  54.95 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  35.67 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  35.99 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  54.76 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  51.08 
 
 		 265 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  38.54 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  37.81 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  34.82 
 
 		 272 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  54.49 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  34.62 
 
 		 258 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  36.08 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  34.29 
 
 		 258 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 264 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  33.86 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  33.64 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  35.62 
 
 		 258 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  35.62 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  32.17 
 
 		 256 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.97 
 
 		 258 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  33.97 
 
 		 258 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  31.53 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  31.53 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  33.12 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  33.12 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  34.81 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  36.79 
 
 		 259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  32.71 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  33.12 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  33.02 
 
 		 258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  31.53 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  32.8 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  33.97 
 
 		 256 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  35.85 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  35.85 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.35 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  33.23 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  34.16 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  33.76 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  32.61 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  34.16 
 
 		 269 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  32.38 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  30.57 
 
 		 260 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  34.39 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  34.92 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  32.8 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  33.01 
 
 		 258 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  33.65 
 
 		 258 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.91 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  30.57 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  31.66 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  31.13 
 
 		 262 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  29.3 
 
 		 261 aa  159  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  32.91 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  32.91 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  32.59 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  33.13 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  31.96 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  31.87 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  32.06 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.23 
 
 		 260 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  32.39 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  32.91 
 
 		 254 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  31.19 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  32.49 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  30.77 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>