More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4198 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  75.29 
 
 		 264 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  71.37 
 
 		 264 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  70.61 
 
 		 275 aa  377  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  67.04 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  66.79 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  67.55 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  66.29 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  66.92 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  65.78 
 
 		 263 aa  358  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  68.3 
 
 		 266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  67.29 
 
 		 263 aa  354  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  65.4 
 
 		 264 aa  351  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  63.91 
 
 		 267 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  63.91 
 
 		 267 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  63.53 
 
 		 267 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  63.1 
 
 		 272 aa  339  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  63.2 
 
 		 262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  62.13 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  62.77 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  61.96 
 
 		 275 aa  322  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  55.24 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  56.67 
 
 		 262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  55.13 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  55.17 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  53.96 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  52.08 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  55.47 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  51.06 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  52.45 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  52.26 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  46.77 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  43.51 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  47.92 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  43.13 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  44.78 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  44.32 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  43.73 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  42.97 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  43.07 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  43.07 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 260 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.32 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.31 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.31 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.31 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  41.42 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  41.98 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 		 268 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  41.95 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  42.48 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  41.7 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 277 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  40.91 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  43.98 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  43.98 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  40.98 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.94 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  40.93 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  43.94 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  40.68 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  41.35 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  41.35 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  41.95 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  40.6 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  40.3 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  41.98 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  39.77 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>