More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1920 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 262 aa  545  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  60.63 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  59 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 261 aa  314  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  59.32 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  56.15 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  56.7 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  56.32 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  57.42 
 
 		 259 aa  302  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  56.54 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  57.25 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  56.87 
 
 		 264 aa  297  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  58.04 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  58.04 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  55.38 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  54.9 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  52.69 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  55.86 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  52.69 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  52.69 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  54.72 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  56.08 
 
 		 259 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  53.46 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  55 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  53.46 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  55.12 
 
 		 266 aa  288  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  54.96 
 
 		 263 aa  288  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  54.96 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  55.3 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  55.64 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.94 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  55.73 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  59.45 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  53.64 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  52.33 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.94 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  54.09 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  48.43 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  49.8 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  49.41 
 
 		 259 aa  244  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  49.02 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  47.45 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  47.45 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  48.05 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  47.84 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  46.88 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  48.24 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  44.71 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  46.48 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  46.85 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  45.74 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  45.14 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  45.28 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  47.06 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  46.69 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  46.3 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  46.48 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  44.84 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  45.1 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.27 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.7 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  45.31 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  47.45 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  46.88 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  39.43 
 
 		 281 aa  211  7e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  47.66 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  37.91 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  40.82 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  40.54 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  40.82 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  42.02 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  37.88 
 
 		 260 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  39.23 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  34.59 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  34.59 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  39.78 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.06 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  39.77 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  36.82 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  38.85 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  37.79 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>