More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0156 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 259 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  72.16 
 
 		 256 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  67.83 
 
 		 271 aa  361  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  54.51 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  58.24 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  54.09 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  55.69 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  54.51 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  54.09 
 
 		 303 aa  298  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  56.08 
 
 		 283 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  56.42 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  56.42 
 
 		 261 aa  295  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  55.29 
 
 		 308 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  53.33 
 
 		 259 aa  291  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  53.7 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  52.92 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  54.51 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  55.08 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  52.53 
 
 		 257 aa  288  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  54.09 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  52.53 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  54.12 
 
 		 270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  53.33 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  50.59 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  54.3 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  54.12 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  52.34 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  50.59 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  54.44 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  54.05 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  50.98 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  51.75 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  54.69 
 
 		 263 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  50 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  52.16 
 
 		 264 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  54.48 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  53.08 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  49.41 
 
 		 274 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  53.52 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  52.16 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  52.33 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  53.67 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  51.76 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  51.35 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  52.12 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 264 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  49.03 
 
 		 284 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  52.47 
 
 		 266 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  51.15 
 
 		 262 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  49.41 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  51.95 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  51.92 
 
 		 270 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  50.77 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  50.77 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  52.11 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  51.36 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  50.77 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  48.65 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  47.08 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  47.69 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  48.25 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.08 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  48.66 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  46.15 
 
 		 267 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  50.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  46.3 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  47.08 
 
 		 276 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  45.53 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.27 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  42.08 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  42.08 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  43.75 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  40.86 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  43.97 
 
 		 254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.64 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  38.82 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  44.05 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  37.88 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  38.76 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  40.31 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  37.21 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.13 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  37.25 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  36.58 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>