More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0660 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
263 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
263 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  62.02 
 
 
262 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  60.85 
 
 
260 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  60.47 
 
 
260 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  60.47 
 
 
279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  56.49 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  59.22 
 
 
264 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  57.47 
 
 
263 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  57.47 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  55.21 
 
 
261 aa  311  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  55.6 
 
 
267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  53.46 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  54.05 
 
 
263 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  53.1 
 
 
261 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  53.67 
 
 
263 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  53.88 
 
 
259 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  53.28 
 
 
266 aa  294  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  53.88 
 
 
259 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  52.11 
 
 
276 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.49 
 
 
266 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  51.71 
 
 
263 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  52.33 
 
 
259 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  52.12 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  50.37 
 
 
268 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  53.1 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  53.82 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 
270 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  50.39 
 
 
259 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  50.57 
 
 
264 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  52.33 
 
 
258 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 
264 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  48.28 
 
 
262 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  51.34 
 
 
264 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  46.33 
 
 
303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  45.95 
 
 
260 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  44.94 
 
 
266 aa  238  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.51 
 
 
256 aa  235  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  45.56 
 
 
259 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  46.74 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  45 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  43.63 
 
 
261 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  43.46 
 
 
260 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  43.24 
 
 
262 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  44.4 
 
 
269 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  44.62 
 
 
263 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 
283 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  44.02 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  43.63 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  43.85 
 
 
308 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  43.24 
 
 
255 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  42.08 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  42.47 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  44.02 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  43.51 
 
 
264 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 
270 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 
256 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  42.08 
 
 
261 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  42.08 
 
 
266 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  42.47 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  42.31 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  41.31 
 
 
255 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 
281 aa  211  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  41.31 
 
 
265 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  40.77 
 
 
255 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  40.93 
 
 
264 aa  208  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 
257 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  41.92 
 
 
256 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.08 
 
 
256 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.3 
 
 
260 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.31 
 
 
274 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  39.23 
 
 
284 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  38.93 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  38.61 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 
277 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  38.77 
 
 
279 aa  195  7e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  38.7 
 
 
256 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  38.31 
 
 
256 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  37.41 
 
 
268 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  37.6 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
258 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 
254 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
322 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  35 
 
 
267 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 
260 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  36.05 
 
 
272 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 
261 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  37.6 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  37.6 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  35.66 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  37.69 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>