More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1001 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  52.17 
 
 		 281 aa  311  4.999999999999999e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  52.9 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  42.58 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  41.73 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  40.55 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  39.46 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  42.13 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.98 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  41.41 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  39.61 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  38.85 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  38.85 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.7 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  37.69 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  38.22 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  39.31 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  39.77 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  38.52 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  38.52 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  37.89 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  39.84 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  34.88 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  37.84 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  39.16 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  35.27 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  36.82 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 260 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  36.47 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  34.12 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  38.52 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  36.08 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  34.11 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  36.54 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  35.83 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.86 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.45 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  34.08 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  35.43 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.08 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  36.29 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  35.43 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  35.41 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  36.08 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  34.43 
 
 		 288 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.87 
 
 		 281 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  34.08 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  32.68 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  34.9 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  32.68 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  36.15 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  32.68 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  36.12 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  34.63 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  36.12 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.29 
 
 		 256 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  36.58 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  35.46 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  36.29 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  35.52 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  35.36 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  34.9 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>