26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0327 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 391 aa  808    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  35.57 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.51 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.14 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.14 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  27.45 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  24.21 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  26.67 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.64 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  23.89 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.97 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.07 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.62 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.19 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.02 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.85 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  35.16 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>