35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3447 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  100 
 
 		 200 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.01 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.77 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  35.84 
 
 		 334 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.17 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.4 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.23 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  39.02 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  35.39 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.7 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.9 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.88 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.21 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 		 351 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  29.94 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  31.63 
 
 		 369 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39 
 
 		 328 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  37.27 
 
 		 352 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.96 
 
 		 340 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.16 
 
 		 391 aa  45.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 		 331 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  34.65 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.35 
 
 		 335 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 		 328 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>