61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0337 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 323 aa  620  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  43.51 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.31 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.59 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  44.1 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.85 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  42.49 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.93 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.14 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.03 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.73 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.57 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.72 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.33 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.22 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.21 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.87 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.85 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  36.53 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.72 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.92 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.67 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  38.01 
 
 		 200 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  43.09 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  30.74 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  19.94 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.04 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  27.11 
 
 		 673 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.83 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.49 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  37.6 
 
 		 177 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.88 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  23.91 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  35.77 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  21.7 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.39 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  27.63 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5052  hypothetical protein  30.58 
 
 		 511 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>