25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4831 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  43.06 
 
 
299 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 
304 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  37.12 
 
 
358 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  40.27 
 
 
347 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  36.09 
 
 
321 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.79 
 
 
392 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.42 
 
 
371 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
324 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  36.97 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.14 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.95 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  27.46 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.04 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.9 
 
 
344 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
387 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>