47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0260 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
340 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.41 
 
 
340 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 
335 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.15 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  25.16 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  23.51 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  24.62 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.58 
 
 
325 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.9 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.42 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  24.17 
 
 
334 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.73 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  24.73 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.3 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.07 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  24.5 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.4 
 
 
365 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  22.11 
 
 
359 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  23.1 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.86 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.56 
 
 
387 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.6 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.53 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.67 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.72 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.45 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.99 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 
328 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.59 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  23.18 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  23.04 
 
 
244 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>