38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3875 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 353 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  96.6 
 
 		 353 aa  624  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  42.61 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.6 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.88 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.95 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.16 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  38.83 
 
 		 372 aa  258  7e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.82 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.43 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.55 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.55 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  43.98 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  41.33 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  25.53 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  25.53 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.43 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 		 808 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.78 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  30.65 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  31.94 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  26.25 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.91 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.65 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.23 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.83 
 
 		 617 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>