61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0622 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  99.69 
 
 		 357 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.65 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.9 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.47 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.65 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.36 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.65 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  23.65 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  22.65 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.58 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.57 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  28.4 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  27.44 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.84 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.45 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.11 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  23.21 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.38 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.08 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.31 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  24.64 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 		 576 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.53 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 		 837 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.54 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0240  hypothetical protein  34.94 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00126667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 		 230 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.88 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>