62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2319 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.96 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.73 
 
 		 292 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.53 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  46.44 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.69 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  42.24 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  44.49 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  44.13 
 
 		 263 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  44.4 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  39.71 
 
 		 281 aa  205  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  42.92 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  42.11 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  42.15 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  42.15 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  43.98 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.15 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  43.98 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  43.98 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  43.04 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  41.7 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  41.7 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  41.7 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  41.7 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  41.7 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  42.36 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  43.64 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  40.16 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.35 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  37.79 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  32.49 
 
 		 243 aa  109  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  33.05 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  29.96 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  33.76 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  33.5 
 
 		 247 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  38.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  38.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  38.54 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  38.54 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  38.64 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.64 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.64 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.08 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  32.54 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  32.54 
 
 		 357 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>