46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3140 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  94.27 
 
 		 261 aa  507  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  74.23 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  72.31 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  72.31 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  72.31 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  73.66 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  72.31 
 
 		 266 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  71.92 
 
 		 266 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  71.54 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  71.54 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.54 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  71.65 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  73.41 
 
 		 257 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  68.34 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  68.25 
 
 		 253 aa  358  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  68.25 
 
 		 253 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  61.19 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.92 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.04 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  44 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  43.38 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  43.64 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  41.85 
 
 		 281 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.28 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.53 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.68 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.25 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  37.67 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  37.56 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  31.6 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  31.1 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  32.94 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  30.49 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  29.91 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.43 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>