47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1580 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.83 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.02 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.69 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  39.92 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  38.19 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  35.32 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  34.32 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  35.74 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  35.74 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  35.74 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.85 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  34.58 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.17 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  34.17 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  34.17 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  35.84 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  34.17 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  34.17 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  34.17 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  34.17 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  34.17 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  34.17 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  36.68 
 
 		 262 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  32.78 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  32.92 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  32.92 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  32.92 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  32.92 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  38.95 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  37.04 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  34.08 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  31.92 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  34.39 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  33.18 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  32.19 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  29 
 
 		 279 aa  92  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4433  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.23 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.23 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3736  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.04 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>