30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3736 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3736  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 362 aa  730    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4669  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  63.88 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1151  hypothetical protein  62.46 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4304  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.28 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.77 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12670  hypothetical protein  61.86 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.734667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1637  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5219  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.98 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00354084  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12480  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.64 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0029  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.97 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0182707 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1017  metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.48 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5215  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.94 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5318  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.48 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4801  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.94 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.48 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5185  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.48 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4902  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4783  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.29 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0512  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.72 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0587  hypothetical protein  27.65 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.63 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6252  hypothetical protein  26.9 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17058  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  30.93 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>