33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4669 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4669  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 363 aa  744    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4304  endonuclease/exonuclease/phosphatase  89.61 
 
 		 380 aa  627  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.78 
 
 		 375 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3736  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.97 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1151  hypothetical protein  59.64 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12670  hypothetical protein  59.35 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.734667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1637  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.85 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0512  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.61 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5219  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.42 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00354084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0029  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.42 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0182707 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1017  metal-dependent hydrolase  23.26 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.04 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5318  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.04 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4801  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.87 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4783  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.81 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.04 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4902  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5185  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.66 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12480  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5215  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.78 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.69 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 		 808 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0587  hypothetical protein  26.27 
 
 		 222 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.51 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  26.12 
 
 		 673 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.55 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.13 
 
 		 576 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>