22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0512 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0512  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 391 aa  807    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516885 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12480  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  60.11 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1534  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1017  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1637  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.56 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5219  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.89 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00354084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0029  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.89 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0182707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5215  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.28 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5185  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.26 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4902  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.17 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4801  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.26 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5318  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.63 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.63 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.94 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4783  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.54 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0587  hypothetical protein  34.15 
 
 		 222 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4669  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.32 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3736  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.72 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4304  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12670  hypothetical protein  23.38 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.734667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1151  hypothetical protein  23.61 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>