86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1830 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  55.56 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  54.48 
 
 		 282 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  48.52 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.4 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.55 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.84 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.25 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  43.7 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  43.7 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  43.7 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  42.98 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  42.98 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.98 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  42.54 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.19 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  42.54 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  42.54 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  42.54 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  42.54 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  42.54 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  41.92 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  42.79 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  41.85 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  40.79 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  40.69 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  39.91 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  38.74 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  30.9 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  40.91 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  30.92 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  28.81 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  29.74 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  26.81 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  31.11 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  30.37 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.57 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  30.4 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.9 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  30.4 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.21 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  37.82 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.38 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  35.63 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.71 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  35.54 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.78 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5052  hypothetical protein  27.47 
 
 		 511 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.78 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.21 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.21 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.69 
 
 		 249 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>