58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2456 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  40.33 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  36.84 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  32.75 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  32.75 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  32.75 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  31.78 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  30.62 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  31.44 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  31.44 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  30.9 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  31.6 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  31 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  30.04 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  30.04 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  30.04 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  30.04 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  31.88 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  29.61 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  31.23 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  31.78 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  32 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  29.49 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  29.13 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  32.9 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  31.14 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  30.08 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.49 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.49 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  27.31 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  27.31 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.96 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 		 355 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.94 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.94 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.81 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.78 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10907  hypothetical protein  24.1 
 
 		 500 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  24.31 
 
 		 245 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.46 
 
 		 358 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.64 
 
 		 262 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>