47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0296 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  99.62 
 
 
266 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  99.62 
 
 
266 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  94.36 
 
 
266 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  96.91 
 
 
259 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  96.91 
 
 
259 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  96.91 
 
 
259 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  78.74 
 
 
257 aa  414  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  74.71 
 
 
260 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  72.31 
 
 
262 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  74.8 
 
 
253 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  74.8 
 
 
253 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  71.54 
 
 
261 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  67.43 
 
 
263 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  68.38 
 
 
255 aa  364  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  62.31 
 
 
278 aa  353  2e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  45.02 
 
 
284 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.7 
 
 
284 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.07 
 
 
285 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  40.87 
 
 
281 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  39.29 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  42.54 
 
 
281 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.6 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37 
 
 
293 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.01 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
269 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  38.12 
 
 
304 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  34.39 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  29.74 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  30.04 
 
 
279 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  35.2 
 
 
247 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  33.04 
 
 
258 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  29.39 
 
 
243 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.06 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.06 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.17 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1429  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 
204 aa  42  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>