60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1933 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.93 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.07 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.23 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  43.64 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  40.25 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  39.38 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  39.38 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  39.38 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  37.45 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  35.57 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  38.5 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  37.02 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  35.83 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  36.22 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  36.6 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  36.6 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  36.6 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  36.6 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  35.32 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  38.72 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.21 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  37.67 
 
 		 255 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  34.91 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  35.48 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  34.18 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  31.33 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  29.84 
 
 		 247 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.86 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.86 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  25.36 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  25.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  25.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.74 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.74 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>