55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2407 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  50.91 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  50.92 
 
 		 282 aa  291  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  49.03 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.12 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.44 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.64 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  46.29 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  45.02 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  45.02 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.02 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  46.58 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.85 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  43.64 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  41.8 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  42.92 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  42.92 
 
 		 253 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  42.92 
 
 		 253 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  42.11 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  42.34 
 
 		 263 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.92 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  42.02 
 
 		 304 aa  171  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  32.05 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  32.44 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  31.06 
 
 		 243 aa  106  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  35.67 
 
 		 247 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  29.13 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 335 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.03 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>