48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1468 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  530  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  65.61 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  34.82 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  34.82 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  34.82 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  34.22 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  35.45 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.79 
 
 		 284 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  33.94 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  33.94 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.94 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  34.55 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  34.39 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  34.39 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  34.39 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  34.39 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.18 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.48 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  32.44 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  31.14 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  31.08 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  31.05 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  29.87 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  30.49 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  30.14 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  31.35 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  30.59 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  31.51 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  29.74 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  25.42 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  33.61 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.72 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  37.8 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>