66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03217 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  77.94 
 
 		 281 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  56.54 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  50.92 
 
 		 284 aa  291  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.24 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.7 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.7 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  43.32 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  43.32 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  43.32 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.43 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  43.38 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  42.15 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  42.73 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.92 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  42.98 
 
 		 261 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  41.96 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  40.18 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  40.18 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.18 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  40.18 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  40.18 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  40.18 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  40.18 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  40.18 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  40.18 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  39.85 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  39.91 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  39.73 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.85 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  34.02 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  39.24 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  32.07 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  29.49 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  30.51 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  31.35 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.88 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.94 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.93 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.93 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 358 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.58 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.8 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  31.82 
 
 		 270 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.82 
 
 		 270 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  31.82 
 
 		 270 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.82 
 
 		 270 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.82 
 
 		 270 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.82 
 
 		 270 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>