26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1015 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 301 aa  596  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.69 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 335 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  28.38 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  27.61 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.32 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.56 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  24.68 
 
 		 372 aa  52.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.2 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 365 aa  49.3  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 		 355 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  24.55 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0469  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.41 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.02 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.33 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>