25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0469 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0469  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 257 aa  526  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.11 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.77 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.41 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.73 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  21.62 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.55 
 
 		 260 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 328 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>