24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1778 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
299 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.69 
 
 
301 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  29.18 
 
 
357 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  29.18 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 
337 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  24.29 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.3 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.76 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.68 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.31 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0469  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.9 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>