24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0859 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 367 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  29.36 
 
 		 340 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.86 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.13 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.95 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  29.03 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.01 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.81 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 		 289 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.43 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.46 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.25 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.26 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.81 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.34 
 
 		 808 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.82 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1508  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.6 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05370  phospholipase C, putative  24.66 
 
 		 529 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>