More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3233 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  67.42 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  66.92 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  67.17 
 
 		 268 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  67.17 
 
 		 268 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  63.77 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  62.64 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  60.9 
 
 		 267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  63.81 
 
 		 270 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  59.02 
 
 		 271 aa  345  6e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  60.75 
 
 		 272 aa  339  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  59.09 
 
 		 270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  59.47 
 
 		 270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  55.36 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  58.33 
 
 		 270 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  57.72 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  56.88 
 
 		 295 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  59.09 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  56.55 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  54.45 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  59.47 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  59.47 
 
 		 269 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  55.76 
 
 		 271 aa  311  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  57.2 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  56.44 
 
 		 269 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  57.68 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  56.02 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  55.3 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  56.77 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  53.38 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  50.92 
 
 		 270 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  55.47 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.91 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  50.57 
 
 		 262 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  51.72 
 
 		 285 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  49.43 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  54.55 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  48.88 
 
 		 268 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  39.47 
 
 		 259 aa  159  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  39.19 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  37.92 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  37.55 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  36.02 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  35.34 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  32.09 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  38.02 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  33.83 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  35.34 
 
 		 265 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  34.87 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  34.91 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.87 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  35.96 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.66 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  34.59 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  35.5 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  34.73 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  36.6 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  35.21 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  36.73 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  37.41 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  37.92 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  34.36 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  38.7 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  35.71 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  33.71 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  35.19 
 
 		 256 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  35.34 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  37.13 
 
 		 258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  34.23 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  34.87 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  34.85 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  35.09 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  36.67 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  35.71 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  34.72 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  34.83 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  34.6 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>