More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0045 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  65.27 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  58.02 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  54.91 
 
 		 290 aa  298  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  55.73 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  55.73 
 
 		 289 aa  298  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  58.87 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  55.85 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  54.89 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  56.87 
 
 		 267 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  55.47 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  53.44 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  54.51 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  54.1 
 
 		 272 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  53.79 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  54.75 
 
 		 270 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  53.23 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  53.41 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  53.41 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  51.88 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  53.73 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.23 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  50.74 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  52.83 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  52.09 
 
 		 352 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  52.06 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  51.14 
 
 		 271 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  53.64 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  50 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  49.44 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  51.71 
 
 		 262 aa  254  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 262 aa  251  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  52.65 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  47.91 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  42.59 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  43.87 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  37.78 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  37.78 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.23 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  36.3 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  35.82 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  34.48 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  34.34 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  35.23 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  34.57 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  32.83 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  34.1 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  34.09 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  36.15 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  32.2 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  36.26 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  35.79 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  35.66 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  34.18 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  34.91 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  34.8 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  33.95 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  33.71 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  34.91 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  35.56 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  31.25 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  32.46 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  34.93 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  33.22 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  34.34 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  34.94 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  32.71 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  33.82 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>