More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0194 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  59.71 
 
 		 272 aa  358  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  59.93 
 
 		 270 aa  348  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  58.09 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  56.62 
 
 		 271 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.04 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  55.36 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  57.25 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  54.17 
 
 		 289 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  55.88 
 
 		 268 aa  324  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  56.25 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  54.41 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  56.25 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  56.62 
 
 		 270 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  55.52 
 
 		 352 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  54.41 
 
 		 269 aa  321  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  55.68 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  56.99 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  52.38 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  52.21 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  54.24 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  53.68 
 
 		 267 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  53.31 
 
 		 267 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  51.11 
 
 		 269 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  51.11 
 
 		 269 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  50.74 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  54.91 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  49.1 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  51.88 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  51.66 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  51.1 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  50.37 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  48.9 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  49.26 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  49.26 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  48.9 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.52 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  49.63 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  46.99 
 
 		 263 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  50.61 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  35.59 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  35.38 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  35.51 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  35.51 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  35.14 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  35.02 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  35.14 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.82 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  34.66 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  33.33 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  34.66 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  34.66 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  29.56 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  35.04 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  34.42 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  37.09 
 
 		 258 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  34.29 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  33.7 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000137718  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  35.07 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  33.7 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000202985  hitchhiker  0.0000000000656111 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  36.96 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  34.06 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  33.7 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000224276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  33.7 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000050651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  32.61 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  32.13 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  35.79 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  34.56 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  32.61 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  33.94 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  30.88 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  33.69 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  33.09 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000598983  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  32.33 
 
 		 256 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  30.48 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  32.84 
 
 		 262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  32.71 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  30.48 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  34.29 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  33.82 
 
 		 276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  36.5 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  32.25 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  32.98 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  36.5 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  37.73 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  31.95 
 
 		 256 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  32.98 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  32.59 
 
 		 260 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  35.51 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  34.29 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  29.09 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  33.83 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  35.97 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  31.62 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  34.17 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>