More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3190 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  62.36 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  59 
 
 		 264 aa  321  8e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  55.02 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  52.26 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  51.89 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  54.17 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  51.32 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  51.32 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  52.63 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  48.31 
 
 		 269 aa  264  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 268 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  50.38 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  49.06 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  48.68 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  47.57 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  47.57 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  50.94 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  51.32 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  49.08 
 
 		 352 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  47.57 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  47.76 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.84 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  47.76 
 
 		 269 aa  252  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  47.78 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  46.99 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.27 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  46.1 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  46.67 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  45.52 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  41.53 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  42.59 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  37.41 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  36.03 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  35.51 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.56 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  34.72 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  34.2 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  32.96 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  34.96 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  35.98 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  33.71 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  34.96 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  35.19 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  32.58 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  33.82 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  31.29 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  34.96 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  33.09 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  32.08 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  32.08 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.21 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  32.22 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  31.29 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.22 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  35.53 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  30.66 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  33.95 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  34.47 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  30.66 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  35.23 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  31.84 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.19 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  33.08 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.81 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  32.84 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  32.59 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  33.59 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  36.13 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>