More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0414 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  65.27 
 
 		 270 aa  345  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  56.55 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  56.34 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  55.22 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  55.22 
 
 		 269 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  54.85 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  54.1 
 
 		 269 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  55.43 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  54.31 
 
 		 267 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  53.36 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  53.76 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  53.21 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  54.28 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  51.5 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  53.73 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  51.85 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  51.87 
 
 		 268 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  53.33 
 
 		 271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  52.04 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  52.79 
 
 		 270 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  51.66 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  50.94 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  50.94 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  52.96 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.42 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.66 
 
 		 293 aa  262  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  51.85 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  51.15 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  50.19 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  49.43 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  49.43 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  49.08 
 
 		 270 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  48.33 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  44.53 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  49.39 
 
 		 249 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  46.13 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  35.96 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  34.08 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  33.58 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  33.58 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  36.36 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  34.33 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  35.16 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  35.09 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  34.57 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  33.83 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  34.09 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  34.44 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  32.71 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  32.46 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  31.97 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  34.7 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  35.51 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  34.33 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  32.34 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  31.34 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  35.98 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  33.09 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  31.2 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  31.62 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  32.46 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  32.58 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  34.96 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  33.33 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  33.58 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  34.78 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.21 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  34.89 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  31.54 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  32.34 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  32.97 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  34.75 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  34.62 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  29.93 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  31.99 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  33.58 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>