More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4030 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 269 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  99.63 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  95.17 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  86.99 
 
 		 269 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  79.93 
 
 		 269 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  78.44 
 
 		 269 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  61.62 
 
 		 270 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  59.04 
 
 		 293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  59.06 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  61.25 
 
 		 352 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  59.78 
 
 		 270 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  59.04 
 
 		 270 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  58.3 
 
 		 271 aa  327  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  58.52 
 
 		 289 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  58.52 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  58.52 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  58.67 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  59.47 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  55.56 
 
 		 267 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  54.92 
 
 		 271 aa  308  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  56.83 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  55.15 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  54.44 
 
 		 267 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  54.44 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  55.93 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  51.09 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  55.22 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  52.79 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  51.67 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  49.44 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  50.56 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  50.56 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  50 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  53.01 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 		 270 aa  268  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  47.57 
 
 		 263 aa  261  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  47.76 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  44.98 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  37.27 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  38.15 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  36.53 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  36.9 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.16 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.61 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  37.32 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  36.16 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.32 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  37.78 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  36.82 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  36.9 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  32.98 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  35.38 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  36.53 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  36.53 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  37.04 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  36.53 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  38.38 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  35.87 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  37.96 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.16 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  38.01 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  36.16 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  37.73 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  34.56 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  38.52 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  36.9 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  35.97 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  36.94 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  34.34 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  35.56 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.69 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  37.68 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  38.13 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.17 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  35.46 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  34.69 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  37.92 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  37.92 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  35.79 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  36.46 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  37.78 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  36.63 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>