More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2004 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 289 aa  554  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  89.93 
 
 		 268 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  65.92 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  67.17 
 
 		 284 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  64.42 
 
 		 267 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  63.67 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  64.93 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  61.8 
 
 		 271 aa  350  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  60.51 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  59.26 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  60.74 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  58.74 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  59.63 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  59.85 
 
 		 270 aa  330  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  60.52 
 
 		 295 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  59.26 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  58.89 
 
 		 352 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  59.41 
 
 		 293 aa  329  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  57.78 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  58.15 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  58.52 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  58.89 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  58.15 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  56.25 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  56.93 
 
 		 271 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  58.58 
 
 		 262 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  59.55 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  56.77 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  55.43 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  52.57 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  54.2 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  52.43 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  55.73 
 
 		 270 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  52.01 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  52.01 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  52.38 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  51.32 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  50.94 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  46.64 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  45.8 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  38.72 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  34.85 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  34.8 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  36.3 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  33.83 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  34.21 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  33.97 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  34.55 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  35.45 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  33.71 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  35.69 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.66 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  34.33 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  36.47 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  36.16 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  35.93 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.08 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  32.84 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  32.72 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 281 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  37.78 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.81 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  34.31 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  35.85 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  34.72 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  31.52 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  36.64 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  32.46 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  35.23 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.42 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  34.19 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  31.25 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  35.47 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  35.79 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  35.21 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  35.31 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  35.07 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  35.69 
 
 		 265 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  36.06 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>