More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3788 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 285 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  67.18 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  62.36 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  54.79 
 
 		 261 aa  284  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  54.89 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  51.85 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  53.9 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  50.35 
 
 		 352 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  49.25 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 268 aa  271  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  51.14 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  51.88 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  49.64 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  51.34 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  51.34 
 
 		 262 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  50.96 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  51.72 
 
 		 284 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  50.94 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  49.26 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  51.15 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  47.76 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  48.51 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  47.76 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  47.76 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  48 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  46.64 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  49.43 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  49.26 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.34 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  49.08 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  48.29 
 
 		 267 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  48.7 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  48.69 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  48.33 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  47.91 
 
 		 270 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  45.68 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  44.03 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  35.53 
 
 		 256 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  36.09 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  35.56 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  34.43 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  35.16 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  32.84 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  32.84 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  32.84 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  34.19 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  35.69 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  33.95 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.42 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  34.7 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.45 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  34.96 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  34.33 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  34.35 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  31.11 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  35.4 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  34.18 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  32.85 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  34.21 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  32.84 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  31 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  32.71 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  32.47 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  34.6 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  31.48 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  32.58 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  31.48 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  32.23 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  32.23 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  32.84 
 
 		 260 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  32.23 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  34.44 
 
 		 257 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  32.61 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  31.79 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  35.56 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  34.05 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  32.96 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>